10,000 สายพันธุ์ ซึ่งจะถูกสร้างจีโนไทป์โดยการจัดลำดับจีโนไทป์ คอลเลกชันนี้จะประกอบด้วยชุดย่อยของจีโนไทป์ตัวแทนไม่กี่ร้อย (200 ถึง 500) ที่จะถูกฟีโนไทป์ด้วย (ในการทดลองภาคสนามแบบหลายตำแหน่งและภายใต้สภาวะที่มีการควบคุม) จัดลำดับใหม่ทั้งหมดในระดับจีโนม (10 ×) และทรานสคริปโตมิกด้วยยีน การแสดงออกและวิเคราะห์ในระดับเมตาโบไลต์ บนพื้นฐานนี้ และ
การใช้ประโยชน์จากข้อมูลจีโนไทป์
โดยการจัดลำดับเป็น ‘ซิป’ สำหรับสายบริสุทธิ์ทั้งหมด 10,000 สายพันธุ์ จีโนมและทรานสคริปโตมทั้งหมดจะถูกสร้างขึ้นใหม่ พร้อมกับข้อมูลเกี่ยวกับบทบาทฟีโนไทป์สมมุติฐานของยีนจำนวนมาก
แท้จริงแล้ว หนึ่งในผลลัพธ์หลักของโครงการคือการพัฒนาใน P. vulgaris ของแค็ตตาล็อกของ haplotypes ของการเข้าถึงทั้งหมด 10,000 รายการ (‘HapBean’) นอกเหนือจากข้อมูลจีโนมและ
ฟีโนไทป์ที่เกี่ยวข้องและสต็อกเมล็ดพันธุ์
ใหม่แล้ว สิ่งนี้จะเป็นเครื่องมือที่ไม่เหมือนใครสำหรับนักวิทยาศาสตร์ด้านพืชและนักปรับปรุงพันธุ์พืช ยิ่งไปกว่านั้น กิจกรรมสะสมที่จะดำเนินการบนสายบริสุทธิ์ 10,000 สายจะเพิ่มปริมาณข้อมูลที่มีอยู่อย่างก้าวหน้า สำหรับ P. coccineus เราจะมีชุดข้อมูลที่ชัดเจนซึ่งจะเป็นรากฐานสำหรับการพัฒนาและการใช้ทรัพยากรจีโนมของมัน สายพันธุ์เหล่านี้จะได้รับการอนุรักษ์และแจกจ่ายให้กับผู้ใช้ (เช่น ผู้เพาะพันธุ์)
โดยสถาบันชีววิทยาศาสตร์
และทรัพยากรชีวภาพของสภาวิจัยแห่งชาติ (IBBR-CNR) ในเมืองบารี ประเทศอิตาลีความพร้อมใช้งานของเมล็ดพันธุ์ของแต่ละภาคยานุวัติและข้อมูลที่เกี่ยวข้องสามารถใช้โดยผู้เพาะพันธุ์เพื่อวัตถุประสงค์ที่แตกต่างกัน รวมถึง:เพื่อค้นหาอัลลีลต่างๆ ของยีนที่มีฟังก์ชันที่ทราบ (ฟังก์ชันที่ระบุในเป้าหมายหรือในสปีชีส์ที่เกี่ยวข้อง) และมีศักยภาพในการใช้งาน และเพื่อให้ได้ชุดของเชื้อโรคที่มี
องค์ประกอบของอัลลีลที่ต้องการ
เพื่อระบุจีโนไทป์ที่ปรับเปลี่ยนได้มากที่สุด (เช่น กลุ่มตลาดเฉพาะ) ที่มีอัลลีลที่มีประโยชน์ที่ผ่านการตรวจสอบก่อนหน้านี้ในภูมิหลังทางพันธุกรรมที่แตกต่างกัน โดยผลที่ได้คือเร่งการพัฒนาพันธุ์ใหม่ให้เร็วขึ้นเพื่อทำการศึกษาความสัมพันธ์ที่สามารถใช้ประโยชน์จากข้อมูลจีโนมที่มีอยู่ในสายพันธุ์บริสุทธิ์ 10,000 สาย; และเพื่อเลือกชุดย่อยของเชื้อโรคบนพื้นฐานของข้อมูลที่มีอยู่จากโครง
การและจากข้อมูลที่จะสนับสนุนโดยพันธมิตรที่เกี่ยวข้อง
ดังที่จะอธิบายต่อไป BEAN_ADAPT เป็นโครงการเปิดที่เต็มใจที่จะมีส่วนร่วมในการพัฒนา ‘ชุมชนถั่ว’ ซึ่งอาจมีทั้งภาครัฐและเอกชนกลยุทธ์และความสำเร็จBEAN_ADAPT มีเป้าหมายเพื่อให้ชุมชนวิทยาศาสตร์ ผู้เพาะพันธุ์ และอุตสาหกรรมเมล็ดพันธุ์มีความรู้เกี่ยวกับยีน ตำแหน่งลักษณะเชิงปริมาณ และกลไกทางพันธุกรรมที่นำไปสู่การปรับฟีโนไทป์ที่เกี่ยวข้องกับสภาพแวดล้อม พร้อมกับ
การทำแผนที่ตามจีโนมอ้างอิง
สิ่งเหล่านี้จะเป็นเครื่องมือทางพันธุศาสตร์ที่เป็นประโยชน์สำหรับนักพันธุศาสตร์และผู้เพาะพันธุ์ในการสร้างพันธุ์ใหม่ ด้วยกิจกรรมที่เริ่มต้นในช่วงครึ่งหลังของปี 2015 BEAN_ADAPT มีเป้าหมายเพื่อพัฒนาแนวทางแบบบูรณาการเพื่อใช้ประโยชน์จากทรัพยากรพันธุกรรมพืชที่เก็บรักษาไว้นอกถิ่นกำเนิดในธนาคารยีนอย่างมีประสิทธิภาพ เพื่อเพิ่มประโยชน์สูงสุดในการใช้ประโยชน์จากพันธุกรรมพืชและการ
Credit : เว็บบอล
